Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc7a1Q09143 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc7a1Q09143 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc7a1Q09143 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc7a1Q09143 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc7a1Q09143 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc7a1Q09143 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc7a1Q09143 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slc7a1Q09143 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc7a1Q09143 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc7a1Q09143 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc7a1Q09143 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms