Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cass4Q08EC4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cass4Q08EC4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cass4Q08EC4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms