Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gata4Q08369 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gata4Q08369 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gata4Q08369 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms