Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CbfbQ08024 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CbfbQ08024 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CbfbQ08024 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms