Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox9Q04887 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sox9Q04887 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox9Q04887 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox9Q04887 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox9Q04887 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms