Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Emx2Q04744 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Emx2Q04744 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Emx2Q04744 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Emx2Q04744 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Emx2Q04744 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Emx2Q04744 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Emx2Q04744 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Emx2Q04744 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Emx2Q04744 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Emx2Q04744 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Emx2Q04744 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Emx2Q04744 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Emx2Q04744 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Emx2Q04744 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Emx2Q04744 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Emx2Q04744 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Emx2Q04744 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Emx2Q04744 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Emx2Q04744 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Emx2Q04744 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Emx2Q04744 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Emx2Q04744 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Emx2Q04744 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Emx2Q04744 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Emx2Q04744 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Emx2Q04744 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Emx2Q04744 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Emx2Q04744 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Emx2Q04744 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Emx2Q04744 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Emx2Q04744 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Emx2Q04744 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Emx2Q04744 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Emx2Q04744 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms