Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cxcr5Q04683 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxcr5Q04683 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms