Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smpd1Q04519 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smpd1Q04519 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Smpd1Q04519 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smpd1Q04519 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms