Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp11Q02853 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp11Q02853 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp11Q02853 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp11Q02853 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp11Q02853 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms