Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GscQ02591 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GscQ02591 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GscQ02591 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GscQ02591 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GscQ02591 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GscQ02591 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GscQ02591 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GscQ02591 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GscQ02591 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GscQ02591 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GscQ02591 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GscQ02591 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GscQ02591 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GscQ02591 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GscQ02591 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GscQ02591 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GscQ02591 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GscQ02591 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GscQ02591 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GscQ02591 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GscQ02591 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GscQ02591 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GscQ02591 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GscQ02591 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GscQ02591 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GscQ02591 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GscQ02591 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GscQ02591 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GscQ02591 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GscQ02591 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GscQ02591 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GscQ02591 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GscQ02591 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GscQ02591 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GscQ02591 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GscQ02591 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GscQ02591 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GscQ02591 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GscQ02591 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GscQ02591 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GscQ02591 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GscQ02591 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GscQ02591 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GscQ02591 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GscQ02591 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GscQ02591 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GscQ02591 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GscQ02591 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GscQ02591 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GscQ02591 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GscQ02591 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GscQ02591 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GscQ02591 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GscQ02591 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GscQ02591 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GscQ02591 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GscQ02591 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GscQ02591 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GscQ02591 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GscQ02591 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GscQ02591 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GscQ02591 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GscQ02591 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GscQ02591 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GscQ02591 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GscQ02591 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GscQ02591 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GscQ02591 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GscQ02591 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GscQ02591 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GscQ02591 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GscQ02591 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GscQ02591 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GscQ02591 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GscQ02591 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GscQ02591 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GscQ02591 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GscQ02591 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GscQ02591 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GscQ02591 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GscQ02591 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GscQ02591 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GscQ02591 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GscQ02591 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GscQ02591 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GscQ02591 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GscQ02591 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GscQ02591 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GscQ02591 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GscQ02591 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GscQ02591 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GscQ02591 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GscQ02591 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GscQ02591 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GscQ02591 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GscQ02591 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GscQ02591 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GscQ02591 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GscQ02591 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.1 ms