Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp39Q02525 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp39Q02525 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp39Q02525 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms