Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf7Q00417 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcf7Q00417 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcf7Q00417 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms