Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PgrQ00175 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PgrQ00175 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PgrQ00175 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PgrQ00175 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PgrQ00175 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PgrQ00175 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PgrQ00175 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PgrQ00175 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PgrQ00175 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PgrQ00175 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PgrQ00175 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PgrQ00175 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PgrQ00175 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PgrQ00175 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PgrQ00175 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PgrQ00175 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PgrQ00175 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PgrQ00175 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PgrQ00175 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PgrQ00175 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PgrQ00175 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms