Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rbbp6P97868 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rbbp6P97868 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rbbp6P97868 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbbp6P97868 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms