Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
AlkP97793 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
AlkP97793 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
AlkP97793 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
AlkP97793 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
AlkP97793 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
AlkP97793 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
AlkP97793 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
AlkP97793 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
AlkP97793 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
AlkP97793 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
AlkP97793 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
AlkP97793 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
AlkP97793 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
AlkP97793 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
AlkP97793 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
AlkP97793 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
AlkP97793 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
AlkP97793 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
AlkP97793 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
AlkP97793 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
AlkP97793 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
AlkP97793 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
AlkP97793 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
AlkP97793 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
AlkP97793 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
AlkP97793 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
AlkP97793 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
AlkP97793 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
AlkP97793 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
AlkP97793 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
AlkP97793 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
AlkP97793 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
AlkP97793 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
AlkP97793 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
AlkP97793 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
AlkP97793 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
AlkP97793 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
AlkP97793 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
AlkP97793 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
AlkP97793 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
AlkP97793 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
AlkP97793 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
AlkP97793 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
AlkP97793 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
AlkP97793 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
AlkP97793 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
AlkP97793 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
AlkP97793 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
AlkP97793 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
AlkP97793 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
AlkP97793 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
AlkP97793 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
AlkP97793 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
AlkP97793 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
AlkP97793 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
AlkP97793 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
AlkP97793 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
AlkP97793 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
AlkP97793 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
AlkP97793 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
AlkP97793 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
AlkP97793 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
AlkP97793 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
AlkP97793 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
AlkP97793 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
AlkP97793 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
AlkP97793 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
AlkP97793 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
AlkP97793 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
AlkP97793 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
AlkP97793 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
AlkP97793 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
AlkP97793 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
AlkP97793 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
AlkP97793 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
AlkP97793 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
AlkP97793 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
AlkP97793 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
AlkP97793 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
AlkP97793 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
AlkP97793 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
AlkP97793 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
AlkP97793 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
AlkP97793 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
AlkP97793 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
AlkP97793 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
AlkP97793 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
AlkP97793 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
AlkP97793 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
AlkP97793 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
AlkP97793 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
AlkP97793 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
AlkP97793 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
AlkP97793 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
AlkP97793 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
AlkP97793 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
AlkP97793 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
AlkP97793 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
AlkP97793 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms