Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cited1P97769 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cited1P97769 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited1P97769 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cited1P97769 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited1P97769 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cited1P97769 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cited1P97769 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cited1P97769 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cited1P97769 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited1P97769 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited1P97769 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cited1P97769 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms