Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pitx2P97474 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pitx2P97474 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pitx2P97474 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms