Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas1P97459 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas1P97459 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas1P97459 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas1P97459 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas1P97459 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas1P97459 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas1P97459 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas1P97459 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Npas1P97459 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Npas1P97459 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Npas1P97459 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas1P97459 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Npas1P97459 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Npas1P97459 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Npas1P97459 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas1P97459 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas1P97459 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Npas1P97459 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas1P97459 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Npas1P97459 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas1P97459 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas1P97459 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas1P97459 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Npas1P97459 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms