Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nkx2-3P97334 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Nkx2-3P97334 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nkx2-3P97334 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nkx2-3P97334 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nkx2-3P97334 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nkx2-3P97334 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms