Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkdcP97313 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkdcP97313 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkdcP97313 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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