Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HpcaP84075 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HpcaP84075 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HpcaP84075 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HpcaP84075 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HpcaP84075 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HpcaP84075 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HpcaP84075 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HpcaP84075 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HpcaP84075 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HpcaP84075 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HpcaP84075 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HpcaP84075 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HpcaP84075 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HpcaP84075 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HpcaP84075 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HpcaP84075 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HpcaP84075 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HpcaP84075 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HpcaP84075 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HpcaP84075 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HpcaP84075 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HpcaP84075 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HpcaP84075 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HpcaP84075 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HpcaP84075 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HpcaP84075 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HpcaP84075 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HpcaP84075 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HpcaP84075 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HpcaP84075 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HpcaP84075 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HpcaP84075 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HpcaP84075 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HpcaP84075 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HpcaP84075 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HpcaP84075 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HpcaP84075 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HpcaP84075 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HpcaP84075 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HpcaP84075 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HpcaP84075 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HpcaP84075 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HpcaP84075 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HpcaP84075 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HpcaP84075 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HpcaP84075 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HpcaP84075 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HpcaP84075 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HpcaP84075 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HpcaP84075 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms