Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Otx2P80206 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Otx2P80206 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otx2P80206 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otx2P80206 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otx2P80206 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otx2P80206 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otx2P80206 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otx2P80206 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otx2P80206 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otx2P80206 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otx2P80206 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otx2P80206 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otx2P80206 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otx2P80206 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms