Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjb6P70689 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gjb6P70689 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gjb6P70689 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb6P70689 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms