Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rad50P70388 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rad50P70388 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rad50P70388 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad50P70388 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad50P70388 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad50P70388 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad50P70388 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad50P70388 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad50P70388 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rad50P70388 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rad50P70388 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms