Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Surf6P70279 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Surf6P70279 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Surf6P70279 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Surf6P70279 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Surf6P70279 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf6P70279 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Surf6P70279 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Surf6P70279 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Surf6P70279 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Surf6P70279 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Surf6P70279 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Surf6P70279 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Surf6P70279 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Surf6P70279 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Surf6P70279 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Surf6P70279 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Surf6P70279 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Surf6P70279 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Surf6P70279 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Surf6P70279 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Surf6P70279 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Surf6P70279 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Surf6P70279 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Surf6P70279 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Surf6P70279 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms