Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad54lP70270 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad54lP70270 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad54lP70270 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rad54lP70270 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad54lP70270 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms