Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Plxna3P70208 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Plxna3P70208 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plxna3P70208 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxna3P70208 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxna3P70208 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxna3P70208 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxna3P70208 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxna3P70208 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxna3P70208 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plxna3P70208 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plxna3P70208 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plxna3P70208 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plxna3P70208 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms