Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig1P70193 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrig1P70193 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig1P70193 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig1P70193 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig1P70193 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrig1P70193 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig1P70193 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig1P70193 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrig1P70193 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrig1P70193 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrig1P70193 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lrig1P70193 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrig1P70193 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrig1P70193 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrig1P70193 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms