Protein–RNA interactions for Protein: P70166

Cpeb1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpeb1P70166 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cpeb1P70166 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpeb1P70166 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cpeb1P70166 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms