Protein–RNA interactions for Protein: P63330

Ppp2ca, Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2caP63330 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppp2caP63330 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppp2caP63330 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp2caP63330 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms