Protein–RNA interactions for Protein: P63054

Pcp4, Calmodulin regulator protein PCP4, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4P63054 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcp4P63054 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pcp4P63054 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcp4P63054 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms