Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl39P62892 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl39P62892 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl39P62892 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl39P62892 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms