Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arf6P62331 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arf6P62331 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Arf6P62331 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arf6P62331 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arf6P62331 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf6P62331 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arf6P62331 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arf6P62331 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf6P62331 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf6P62331 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf6P62331 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arf6P62331 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arf6P62331 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arf6P62331 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arf6P62331 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms