Protein–RNA interactions for Protein: P62309

Snrpg, Small nuclear ribonucleoprotein G, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpgP62309 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpgP62309 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpgP62309 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpgP62309 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnrpgP62309 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SnrpgP62309 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnrpgP62309 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnrpgP62309 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SnrpgP62309 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SnrpgP62309 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SnrpgP62309 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SnrpgP62309 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SnrpgP62309 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnrpgP62309 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnrpgP62309 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SnrpgP62309 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SnrpgP62309 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms