Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmc1P62192 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psmc1P62192 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmc1P62192 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmc1P62192 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms