Protein–RNA interactions for Protein: P61793

Lpar1, Lysophosphatidic acid receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpar1P61793 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lpar1P61793 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lpar1P61793 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lpar1P61793 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lpar1P61793 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lpar1P61793 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lpar1P61793 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lpar1P61793 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lpar1P61793 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lpar1P61793 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lpar1P61793 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lpar1P61793 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lpar1P61793 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lpar1P61793 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lpar1P61793 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lpar1P61793 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lpar1P61793 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lpar1P61793 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lpar1P61793 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lpar1P61793 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lpar1P61793 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lpar1P61793 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lpar1P61793 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lpar1P61793 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lpar1P61793 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lpar1P61793 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lpar1P61793 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lpar1P61793 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lpar1P61793 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lpar1P61793 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lpar1P61793 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lpar1P61793 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lpar1P61793 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms