Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stx1bP61264 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx1bP61264 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx1bP61264 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms