Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arf3P61205 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arf3P61205 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arf3P61205 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arf3P61205 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arf3P61205 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arf3P61205 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arf3P61205 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arf3P61205 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arf3P61205 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arf3P61205 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms