Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdo1P60334 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdo1P60334 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdo1P60334 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdo1P60334 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms