Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Vps33bP59016 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Vps33bP59016 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Vps33bP59016 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Vps33bP59016 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Vps33bP59016 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Vps33bP59016 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Vps33bP59016 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vps33bP59016 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vps33bP59016 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vps33bP59016 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Vps33bP59016 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vps33bP59016 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vps33bP59016 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vps33bP59016 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Vps33bP59016 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vps33bP59016 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vps33bP59016 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vps33bP59016 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Vps33bP59016 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Vps33bP59016 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vps33bP59016 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms