Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubgcp3P58854 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubgcp3P58854 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubgcp3P58854 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms