Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm2P58774 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpm2P58774 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm2P58774 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm2P58774 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms