Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Paxbp1P58501 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Paxbp1P58501 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Paxbp1P58501 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Paxbp1P58501 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Paxbp1P58501 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms