Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd4P58467 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd4P58467 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd4P58467 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setd4P58467 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd4P58467 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd4P58467 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd4P58467 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd4P58467 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms