Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pdcd5P56812 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdcd5P56812 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pdcd5P56812 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pdcd5P56812 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pdcd5P56812 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pdcd5P56812 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pdcd5P56812 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms