Protein–RNA interactions for Protein: P55850

Dsc3, Desmocollin-3, mousemouse

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc3P55850 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsc3P55850 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsc3P55850 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsc3P55850 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsc3P55850 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms