Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab2aP53994 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms