Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RabggtbP53612 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RabggtbP53612 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RabggtbP53612 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RabggtbP53612 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RabggtbP53612 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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