Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Cux1P53564 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Cux1P53564 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Cux1P53564 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Cux1P53564 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Cux1P53564 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Cux1P53564 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Cux1P53564 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC35,39■■■■□ 3,26
Cux1P53564 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Cux1P53564 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,39■■■■□ 3,26
Cux1P53564 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,39■■■■□ 3,26
Cux1P53564 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Cux1P53564 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC35,37■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Cux1P53564 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35,37■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,36■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,36■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC35,34■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35,33■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35,33■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,25
Cux1P53564 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Cux1P53564 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Cux1P53564 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Cux1P53564 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,31■■■■□ 3,24
Cux1P53564 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,31■■■■□ 3,24
Cux1P53564 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35,3■■■■□ 3,24
Cux1P53564 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Cux1P53564 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC35,3■■■■□ 3,24
Cux1P53564 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Cux1P53564 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35,29■■■■□ 3,24
Cux1P53564 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Cux1P53564 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Cux1P53564 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Cux1P53564 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Cux1P53564 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Cux1P53564 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,27■■■■□ 3,24
Cux1P53564 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,23
Cux1P53564 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35,26■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,23
Cux1P53564 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC35,26■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Cux1P53564 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC35,24■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35,22■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Cux1P53564 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Cux1P53564 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC35,21■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,2■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35,2■■■■□ 3,23
Cux1P53564 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Cux1P53564 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35,16■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,15■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC35,15■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35,15■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC35,14■■■■□ 3,22
Cux1P53564 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,4 ms