Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpc4P51655 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpc4P51655 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpc4P51655 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpc4P51655 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpc4P51655 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpc4P51655 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gpc4P51655 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms